Doctor honoris causa (Dr. h. c.) je čestný akademický titul, ktorý univerzita udeľuje výnimočným osobnostiam, ktoré sa významne zaslúžili o rozvoj vzdelanosti, vedy, kultúry, alebo inak prispeli k šíreniu myšlienok humanizmu, demokracie a porozumenia medzi národmi a svojím významom zároveň prekročili hranice Slovenska. Tento čestný titul udeľuje Vedecká rada UKF.
- Ján Chryzostom Korec (1998)
- Ladislav E. Roth (1998)
- Zdeněk Mathauser (2000)
- Fernando Henrique Cardoso (2002)
- Ján Kopál, in memoriam (2002)
- Štefan Luby (2002)
- Robert J. Sternberg (2004)
- Ladislav Ťažký (2005)
- Rudolf Schuster (2006)
- Imre Békési (2006)
- Ladislav Burlas (2007)
- Ján Vilikovský (2007)
- Hans-Werner Eroms (2008)
- Katerin Katerinov (2008)
- Ian Francis Hancock (2009)
- Encho Nedyalkov Gerganov (2009)
- Zdeněk Helus, in memoriam (2017)
- Abrahim Habibulla Khan (2017)